故事发生在风景秀美的江西省鄱阳湖畔，主人公“叶叔”是一位在当地颇具声望的前公安干警，退伍后回到家乡开了一家小型私人侦探事务所。鄱阳湖周边区域因独特的地理条件，近年来引进了一项柠檬生态农业项目，其中的一项重要衍生科研成果是利用柠檬废料开发出高效环保的动力系统，特别应用于一款为湖泊水下考古研究定制的潜水艇。当这款潜水艇的设计图纸及其核心技术资料离奇失踪后，当地政府和科研单位焦急万分，遂邀请叶叔介入调查，调查中逐渐发现了一些地方官员的异常举动，故事由此展开。