二十五世纪，S星球，人类在“云端”网络空间中制造了众多具有高度自我意识的虚拟“云端人”。人类担心云端人反叛，将其严格圈禁在云端中。
S星球面临相邻的塞姆星入侵， 云端人叛军趁机占领云端的总统办公室，操控机器人和仿生人袭击总统，并窃取了“反物质武器”机密文件。
“安全联动中心”的组长于卓和同事赶往云端，和叛军大战。于卓跳窗追击叛军头目，却被和自己长得一模一样的蒙面云端人拦截。蒙面云端人名“云于”，是于卓几年前上传意识制造的云端人。
云于被“S星球管理局”和叛军双方追杀，随时面临被删除和被格式化的危险。于卓帮云于逃离云端，寻求自由，谁料卷入精心策划的阴谋中，引发了人类与云端人之间的战争……
