万历年间，身处海外异国日本的许医师，卷入一场谍战风波，身陷囹圄。
许医师的徒弟朱均旺和脱籍军户张申元，决心营救许医师。
两人因此被卷入日本大名之间的政斗攻杀、日本海上的海盗混乱攻伐、葡萄牙人的跨国贸易纠纷等等。
日本大名、海上倭寇、葡萄牙传教士和商人、收取海上保护费的海盗、明朝华人海商大豪等等相继出场。
在救援之路上，朱均旺发现张申元的身份和目的也似乎并不简单。
